Öncelikli olarak eğitim-öğretim çalışmalarına ağırlık verilmektedir. Öğrencilere meslek öğretiminden ziyade, tarıma akademik bir bakış kazandırma felsefesiyle hareket edilmektedir. Türk tarımının öncelikli faaliyet alanları da dikkate alınarak evrensel düşünebilen, sorunlara ve olaylara çok yönlü bakabilen ziraat mühendislerinin yetiştirilmesi Fakültenin en önemli misyonudur.
Bitki Koruma Bölümü Fitopatoloji ve Entomoloji olmak üzere iki Anabilim Dalından oluşmaktadır. Fitopatoloji Anabilim Dalı, Mikoloji, Bakteriyoloji, Viroloji ve Herboloji Bilim Dallarından oluşurken, Entomoloji Anabilim Dalı Akaroloji, Nematoloji ve Uygulamalı Entomoloji Bilim Dallarından oluşmaktadır. Her iki Anabilim Dalı da bölgenin önemli kültür bitkilerinde ekonomik kayba yol açan zararlı, hastalık ve yabancı otların tanımı ve bunlarla mücadele yöntemlerini inceler. Bu konularla ilgili olarak bölümümüzde DPT, TUBİTAK, ve BAP destekli projeler yürütülmektedir. Bitki Koruma Bölümünden mezun olan öğrenciler konuyla ilgili kamu kuruluşlarında iş bulacakları gibi özellikle zirai ilaç bayiliği, hastalık ve zararlılardan ari bitki materyali üretimi ve son yıllarda önem kazanan organik tarım işletmelerinde iş olanağı bulabilmektedirler. Tarımsal üretimde gerek bölgesel, gerekse ülkesel sorunların çözümü, tarımda yeniliklerin geliştirilmesi, eğitimde kullanılacak bilgilerin üretilmesi amacıyla araştırma-geliştirme faaliyetleri eğitim-öğretim etkinliklerinden sonra gelmektedir.
