Balıkçılık su ürünleri işleme teknolojisi ve su ürünleri yetiştiriciliği alanlarında teknolojik bilgilere sahip tsu ürünleri mühendisleri yetiştirmek, öğrencilere bu konularda gerekli uygulamaları staj)yaptırmak, ülkemiz balıkçılığına ve su ürünleri yetiştiriciliğine ve su ürünleri işleme teknolojisi sektörüne yararlı olmaları ve hizmet vermelerini sağlamaktır. Fakülte balıkçılar ve su ürünleri işletmeleri ile ilgili uygulamada çıkan sorunları yerinde saptamak, çözüm önerileri getirmek, ayrıca balıkçıların sorunlarını çözmek üzere gerekli
araştırma ve çalışmaları yapmak amacını taşımaktadır. Bu amaç doğrultusunda bölge balıkçıları ve üretim işletmecileri ile ilişkileri artırmak suretiyle sıkı işbirliğine gidilmektedir. Su Ürünleri Fakültesi mezunlarının çalışma olanakları, kamu kuruluşları, özel kuruluş ve işletmelerdir. Su Ürünleri Mühendisleri, Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı ile Çevre ve Şehircilik Bakanlığı'nın çeşitli birimleri başta olmak üzere, diğer çeşitli kamu kurumları, balıkçılık ve su ürünleri üretim işletmelerinde çalışabilmektedirler.
