Fakülteler
Tıp Fakültesi
Eğitim Fakültesi
İlahiyat Fakültesi
Fen-Edebiyat Fakültesi
Mimarlık Fakültesi
Teknoloji Fakültesi
Merzifon İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi
Meslek Yüksekokulları
Sosyal Bilimler Meslek Yüksekokulu
Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu
Merzifon Meslek Yüksekokulu
Suluova Meslek Yüksekokulu
Gümüşhacıköy Meslek Yüksekokulu
Taşova Meslek Yüksekokulu
Tasarım Meslek Yüksekokulu
Sabuncuoğlu Şerefeddin Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu
Yüksekokullar
Sağlık Yüksekokulu
Enstitüler
Fen Bilimler Enstitüsü
Sosyal Bilimler Enstitüsü
