İstanbul Şehir Üniversitesinde eğitim-öğretim ücrete tabidir.
2017-2018 akademik yılında üniversiteye yerleştirilen öğrenciler için öğrenim ücreti; Psikoloji ve Hukuk lisans programlarında KDV dâhil yıllık 38.180 TL, diğer lisans ve hazırlık programlarında KDV dâhil yıllık 34.900 TL, Meslek Yüksekokulunun tüm önlisans programları için KDV dâhil yıllık 21.000 TL’dir.
